Il vous suffit de créer une image gif animée de 1 pixel par 1 pixel.

Ensuite vous créez une classe dans votre feuille de style :

.clignotant { background:url(votre_image.gif) repeat; }

et dans votre tableau, vous donnez comme propriété à la cellule la classe clignotant :

<td class="clignotant">La valeur en question</td>

Voici un très simple exemple : Cellule clignotante